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染色体8q拷贝数变异与肝细胞癌患者术后总生存期的相关性及其靶基因筛选

【作者】 赵昆 [1] 徐菊英 [2] 许青 [3] 朱忠政 [4]

【关键词】 癌 肝细胞 预后 DNA拷贝数变异 基因表达

摘要】目的 探讨染色体8q拷贝数变异(CNA)与肝细胞癌(HCC)患者术后总生存期(OS)的关系,并筛选生存相关CNA内的潜在靶基因.方法 收集2007—2008年于第二军医大学附属东方肝胆外科医院手术住院的HCC患者187例为研究对象.收集患者一般资料,检测其染色体8q CNA、染色体8q24.13-24.3片段内50个已知基因mRNA表达水平;术后对患者进行随访,最终共66例患者完成随访.一般资料、染色体8q内各高频CNA(增益发生率>20%)片段与OS的相关性分析采用Log-rank检验;采用Cox比例风险回归模型分析OS的影响因素;生存曲线比较采用Log-rank检验;染色体8q24.13-24.3增益HCC患者和8q24.13-24.3无增益HCC患者基因mRNA表达水平比较采用Mann-Whitney U检验.结果 HCC患者糖尿病史、有无完整肿瘤包膜、TNM分期与OS有相关性(P<0.05).单因素Cox比例风险回归模型分析结果显示,染色体8q24.13-24.3增益与OS有相关性(P<0.05);多因素Cox比例风险回归模型分析结果显示,染色体8q24.13-24.3增益、有无糖尿病史、有无完整肿瘤包膜、TNM分期是OS的影响因素(P<0.05).生存分析结果显示,染色体8q24.13-24.3增益HCC患者生存率低于染色体8q24.13-24.3无增益HCC患者(P<0.05).染色体8q24.13-24.3增益HCC患者C8orf76、ATAD2、WDYHV1、FBXO32、TMEM65、TATDN1、ZNF572、SQLE、KIAA0196、NSMCE2、PVT1、FAM49B、ASAP1、NDRG1、ZFAT、KHDRBS3、EIF2C2 mRNA 表 达水平高于染色体8q24.13-24.3无增益HCC患者(P<0.000 1).结论 染色体8q24.13-24.3增益与HCC患者OS有关,可作为HCC的一个预后预测因子.ATAD2、PVT1、NDRG1拷贝数依赖性表达上调可能参与了HCC不良预后的演进过程.

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